次世代シーケンサの簡単なスペック比較
次世代シーケンサのハード面での比較表と作ってみました。インターネットをあさって探したので間違いがあるかもしれません。リード長は最大(short read の場合はpaored-endで読んだ場合)の長さを示してます。行で矛盾があるかもしれません。修正・追加していきますが、ご指摘いただけると助かります。
Read length(MAX) | Run Time | Number of reads | Output(GB) | |||
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short read | Illumina社 | HiSeq200 | 2x100bp | 〜8days | 2G | 150-200 |
GAIIx | 2x75bp | 〜9.5days | 138-168M | 20.5-25 | ||
GAIIe | 2x100bp | 〜9.5days | 180-200M | 18-20 | ||
AB社 | SOLID system3 plus | 2x50bp | 12-14days | >100M | 50-60 | |
SOLID system4 | 2x50bp | 12-16 | 1.4G | 80-100 | ||
Long read | Roche社 | GS FLX | 400bp(AVG) | 10hours | 1M | 0.4-0.6 |
GS junior | 400bp(AVG) | 10hours | 0.1M | 0.035 |