次世代シーケンサ
某大学医学部の先生から、ここのところ立て続けに次世代で病気と関連するSNPを見つけたという論文が出ているとの情報をいただきましたので、ちょっとPubmedを(exome sequencing)というキーワードで検索してみたところ、34の論文(内7月と8月12報)が出て…
Long read と Short read では、使い道が異なります。 Long read の適用分野 Roche社のGSシリーズは、400bases読める(今年の秋には700baseになるそうな)のでLong readと呼ばれています。旧来のサンガー法で読まれた配列もLong read という分類に入るのでし…
次世代シーケンサのハード面での比較表と作ってみました。インターネットをあさって探したので間違いがあるかもしれません。リード長は最大(short read の場合はpaored-endで読んだ場合)の長さを示してます。行で矛盾があるかもしれません。修正・追加して…
次世代シーケンサのデータ解析のポイントをまとめて、会社のホームページにアップしました。次世代シークエンサーデータ解析のポイント | 株式会社メイズ 次世代シークエンサがもたらすもの -スクリーニング手法(三次解析)の重要性- 次世代シークエンサに…
すでに、みなさんご存知かもしれませんが、次世代シーケンサの掲示板がたっていました。次世代シーケンサの情報や次世代シーケンサのデータ解析に関する情報を得るために利用しています。 SEQanswers ニッチな領域にもかかわらず、広告の量からするとそれな…
次世代シーケンサのデータを解析する仕事が少しづつ増えてきました。確かに、次世代シーケンサのデータ量は半端ではありませんが、最近わたしの家庭に500GbyteのUSBハードディスクが登場したことを考えると10Gbyte程度のデータに驚くことはないようにも…