次世代シーケンサ データ解析のポイント
次世代シーケンサのデータ解析のポイントをまとめて、会社のホームページにアップしました。
次世代シークエンサーデータ解析のポイント | 株式会社メイズ
次世代シークエンサがもたらすもの -スクリーニング手法(三次解析)の重要性-
次世代シークエンサによる大量配列解析は、多くの研究者に“手軽で低コストな網羅的解析”の手段を提供することになります。しかしながら、次世代シークエンサによるアプローチも当然のことながら難しい課題をかかえています。。。続きはここをクリック
次世代シークエンサ普及までの過渡期としての課題
次世代シークエンサが当たり前のように利用されるには、もう2,3年はかかるかもしれません。しかしながら、世界中で次世代シークエンサを使った研究が始まっている中。。。続きはここをクリック
アプリケーションとデータ解析の分類
次世代シークエンサを適用できる分野(アプリケーション)は多岐に渡ります。しかしながら、 。。。続きはここをクリック
フリーソフトウエアの選択
次世代シークエンサを“測定機械”として利用する場合、通常、シーケンサメーカから提供されているソフトウエアでベースコール(一次解析)し、その配列をalignerによりマッピング、マッピング情報をもとにシグナル値を出力(二次解析)します。。。続きはここをクリック
解析に利用する公共データの選択
次世代シーケンサのデータ解析では、リファレンスの配列データを使ってマッピングを行ったり、アノテーション情報を利用してスクリーニング処理を行ったりします。転写産物の情報も利用します。しかしながら、 。。。続きはここをクリック
実験を行う前に、データ解析について、ディスカッションすることの重要性
データ解析において、考慮しなければならない要素が沢山あります。また、それは、測定対象のサンプルや実験のデザインとも関係する場合が多々あります。 。。。続きはここをクリック
サービスもまとめてみましたので、ご興味のある方は参考にしてください。
また、共用利用で、次世代シーケンサを導入されたお客様へのパッケージもご用意しております。
共同利用で次世代シークエンサーをお使いになるお客様へ | 株式会社メイズ
※denovo sequence についてサービス内容をまとめているところです。ホームページにアップまではもう少しかかりそうです。