56th ASMSのカンファレンスにいってきました。
ASMS（American Society for Mass Spectrometry）は、アメリカ合衆国の質量分析学会ですが、今年も、多くの国籍を持ったひとが参加されていました。会期は、６月２日から６月７日まででした。
学会の行われたところは、コロラド州の州都であるデンバーにあるコロラドコンベンションセンターです。コンベンションセンターの建物は、おそらく、大きさでは横浜パシフィコ程度で、その１フロアー全部を使って、ポスター発表と企業展示を行っていました。昨年のインデアナポリスは、Indy500が開催されるオーバルコースがあったり、3Aのインディアンズのホーム球場があったりで（生の桑田の投球を見てしまいました。）したが、デンバーは、牛丼の吉野家がアメリカに進出したときの一号店がここだった（ような？）ぐらいで、なにか有名なものがあるのかなと心配していましたが、ありました。
まず、球場はメジャーリーグのロッキーズの球場がありました。Denverは、ロッキー山脈の東側で、標高1マイル（約1600m強）あるところから、マイル-ハイ-シティと呼ばれています。ロッキ−ズのホームグラウンドである「Coors Field」も、マイルーハイと呼ばれています。そう、この球場は、野茂投手がノーヒット・ノーランを達成した球場です。野球だけではありません。アメリカンフットボールは、コロラドブロンコスのホームです。
その他、デンバーにいく前に、デンバーの歴史を少し勉強していたら、AMTREK（大陸横断鉄道）の話が飛び込んできました。デンバーは、鉄道輸送が主力だった時代には、アメリカ大陸の鉄道のほとんどが、デンバーを中心に放射状に伸びていたとのこと。つまり、デンバーは、鉄道輸送時代には、物資や人の集積地であったということです。今は、AMTREKは、１路線だけですが、１日上りと下り１本づつが運転されています。シカゴからサンフランシスコまでです。最終日終了後、デンバーの駅にいって、AMTREKを見ることができ、写真に収めることができました。（駅の警備の人に中を見たいから入れてくれといったのですが、断固として拒否されました。残念...）。Denverからは日帰りでロッキー山脈を観光できる列車も出ていました。（乗ってみたかった...）
ところで、Denver国際空港からバスに乗って市内まで移動したのですが（結構ありました、おそらく、羽田から東京都内くらいはあると思います）、Denverの市内へいく人よりも、ボールダーに行くひとのほうが確実に多かったです。そう、あの高地トレーニングで有名なボールダーは、避暑地でもあるわけです。一日前にDenverに入った人の話では、Qちゃんを空港で見たとのこと。しかしながら、もっとも印象的だったのは、Denver空港の周りに、木がほとんどなく、草も生えていない荒地が広がっていたことと、早朝に通ったハイウエイの混雑振りでした。（朝６時代だったのにいっぱい。アメリカ人はやっぱり働きものでした）
ASMSでの発表内容
今年のASMSでは、昨年、東京都の助成を受けて開発した「Sequence Composer」をCorporate Poster で提案してきました。
- このソフトウエアの機能のひとつは、UniProtのFeature TableのSNPやSplicing Variant、Processing情報を利用して、UniProtのEntry配列から種々のVarinatを作成することです。作成された配列を質量分析結果との照合に使ってもらうことで、次のふたつのメリットをプロテオーム研究者に提供します。
- もうひとつの機能は、UniProtのFeature情報をひと目で見ることができるViewerが用意されていることである。
- Entry配列と加工した配列を見比べることができます。
- Entry配列上でも、加工配列上でも、個々のFeatureTable情報（ドメインや修飾）の位置・領域を確認することができます。
