UniGeneのSoybeanのBuildがアップしました。
UniGeneへの登録配列数は、約350ほど増えており、それほどドラスティックな配列の増加ではありませんでした。
増加した配列の内２００個ほどは5'readのEST配列でしたが、mRNAが約４０個、HTCが約７０個増加したので、その影響で、mRNAの入っているクラスタが約40クラスタ、HTCが入っているクラスタが70クラス多増加しています。完全長を読みきろうというプロジェクトが世界のどこかで着実に進んでいるように思われます。
データ蓄積ページはここです。
Final Number of Sequences
| #26 | #25 | Type | |
|---|---|---|---|
| 1,149 | 1,102 | mRNAs | |
| 0 | 0 | Models | |
| 173 | 107 | HTC | |
| 63,426 | 63,419 | EST, 3'reads | |
| 224,767 | 224,542 | EST, 5'reads | |
| 7,047 | 7,042 | EST, other/unknown | |
| 296,562 | 296,212 | total sequences in clusters |
Final Number of Clusters (sets)
| #26 | #25 | Type | |
|---|---|---|---|
| 21,707 | 21,699 | sets total | |
| 920 | 879 | sets contain at least one mRNA | |
| 144 | 89 | sets contain at least one HTC sequence | |
| 21,635 | 21,618 | sets contain at least one EST | |
| 848 | 798 | sets contain both mRNAs and ESTs |
